明朝从朱元璋开国到崇祯皇帝殉国，共有十六位皇帝，但我们通常所说的明十三陵，实际上只有十三位皇帝的陵墓。那么，另外三位皇帝的陵墓到底去了哪里呢？首先，我们要提到的是明朝的开国皇帝——朱元璋。他是明朝的第一任皇帝，也是唯一一位没有进入十三陵的皇帝。朱元璋在定国之时将首都定在了南京，并在去世后葬于南京东郊的紫金山，陵墓被称为明孝陵。

朱元璋的儿子朱棣在经过深思熟虑后决定将明朝的首都迁到北京，虽然南京仍然保留了作为中央政治的地位，形成了明朝的两京制度。而第二位没有进入十三陵的皇帝是朱元璋的孙子——朱允炆，也就是历史上的建文帝。朱允炆继位后，因遭遇了靖难之变而被自己的叔叔朱棣推翻。朱棣发动叛乱攻占南京，最终取代了朱允炆，登上了皇帝宝座。

南京沦陷后，建文帝下落不明。有人说他在宫中被活活烧死，但没有人能够确认找到确切的尸体，甚至找到的尸体已经烧得面目全非，无法确认是否为建文帝的遗体。还有一种说法认为建文帝在混乱中成功逃脱，远走他乡。据说，朱元璋曾预料到朱棣会发动叛乱，于是给朱允炆留下了一个锦囊妙计，准备了化装成和尚所需的一切物品，若发生危险，朱允炆便可以以此方式逃脱。如果这个说法属实，朱元璋果然是先知般的睿智。

第三位没有进入十三陵的皇帝是朱祁钰。他能够成为皇帝也算是一种机缘巧合。公元1449年的土木堡之变中，瓦剌军队入侵明朝。时任皇帝的朱祁镇（即朱祁钰的哥哥），因听信宦官谗言，带领军队亲征，但在土木堡被瓦剌军包围，最终成为瓦剌的俘虏。

瓦剌军用朱祁镇威胁明朝，但这一计谋未能奏效。朝中群臣上奏太后，决定让朱祁钰继位成为新的皇帝，而朱祁镇则被废为太上皇。瓦剌军愤怒之下进攻北京，但最终被击败，朱祁镇也被带回大漠。朱祁镇在大漠期间，因为宽厚的性格结交了不少朋友，这些朋友同情他，并最终促成了他返回明朝。

然而，这一回归对于朱祁钰来说极为尴尬。因为朱祁镇的归来意味着他要归还皇位，而朱祁钰并不愿意放弃权力。于是，他将朱祁镇软禁在南宫，甚至比在大漠的日子过得还要艰难。七年后，朱祁钰因病去世，石亨发动政变释放朱祁镇，迎他重新登基成为皇帝。朱祁钰被废除并封为邺王，朱祁镇心中积压多年的怨恨让他最终以牙还牙，将朱祁钰软禁在西苑。朱祁钰死后，他被以亲王的礼仪葬在了北京西山。

因此，明十三陵中少了这三位皇帝的陵墓，历史的复杂与波折就像是一出出戏剧，令人唏嘘不已。就这样，曲终人散，留下的是历史的回响。