抗战胜利后，曾经强大的东北军已经四分五裂，昔日的辉煌早已不复存在。虽然它仍然拥有4个军的名号，但实际上，这支军队早已被蒋系的嫡系部队几乎瓜分殆尽。

第51军是东北军的核心部队，也是东北军元老于学忠的主力。1944年，因于学忠得罪了汤恩伯，陷入了政治风波，被悄然调任军事参议院副院长。与此同时，第51军也遭汤恩伯吞并，逐渐成为了蒋系嫡系部队的一部分。

第53军相较而言运气较好。它曾被编入远征军，参加了打通滇缅公路的关键战斗。抗战胜利后，第53军被改编成半美械装备的部队，并且成为蒋系的嫡系部队。很快，它被派往东北，投入内战的战场。

第57军则在蒋系的整编计划下被改编为第十二军，并被派往山东，归王耀武指挥。第49军的命运更为曲折。在原军长刘多荃因权力斗争被暗中降职后，部队一度面临解散的危机。若不是陈诚的及时支持，第49军或许早已散落一地。然而，尽管如此，1946年在整编过程中，第49军还是被改编成了一个以黄埔军官为主的部队，这使得它实质上也成了半嫡系部队。

既然已经是蒋系嫡系部队，第49军当然不会缺席内战的战场。1946年7月，整编后的第49师王铁汉部被派往苏中战场。

1946年5月5日，蒋介石的“还都”南京，正是他意气风发、信心满满的时期。然而，在住进由夫人精心挑选的豪宅后，蒋介石却无法安稳入睡。这并非因为对新环境不适应，而是因为南京附近的解放区，尤其是新四军在苏中和苏北的存在，让他心神不宁。

苏中和苏北的解放区，不仅拥有庞大的土地和人口，还有23座城镇，都是鱼米之乡。尽管蒋介石通过占领扬州、南通等大城市，扩展了自己的控制区域，但黄桥、如皋、海安等地仍牢牢掌握在新四军手中。两军在边界地区的摩擦愈加频繁，尤其是江南和江北的航道争夺让蒋军感到极为不满。

蒋介石担心，如果双方剑拔弩张，激烈冲突一旦爆发，新四军很可能越过长江直抵南京，这将对他的政权构成极大威胁。于是，他决定派兵攻占苏中和苏北，以彻底铲除这个隐患。蒋介石自信兵力上占据绝对优势，派遣了李默庵等黄埔一期的将领，带领5个整编师和两个交通总队，准备一举解决战斗。

然而，李默庵这次的远征却没有预想的顺利。他带领的部队虽然装备精良，战斗经验丰富，但由于过于轻视新四军，最终在苏中战役中大败。战争开始时，蒋军一方信心满满，李天霞等将领甚至认为，单凭他们的一支部队就能轻松击败新四军。然而，事实却让他们措手不及。

在战争的关键时刻，李默庵提出了新四军的灵活战术应当得到重视，但蒋军将领们并未听从。他们自信满满，认为这不过是一场简单的战斗。最终，李默庵因战果不佳，在战争结束后悄然告别了军界。

1946年7月13日，蒋介石的进攻命令已经下达，然而在临战前夕，马歇尔却通过情报得知了蒋军的进攻计划。蒋介石立即下令停止进攻，但这个决定显然为时已晚。新四军的迅速反击，击中了蒋军的薄弱环节，特别是整编83师未做好防备，导致了大规模的伤亡。

蒋军的命令失效，李默庵重新组织了兵力，计划通过多路进攻压制新四军。然而，新四军灵活的战术再次展现出强大优势。通过精准的部署和巧妙的战术，粟裕指挥的部队成功反击，令蒋军陷入困境。

最终，王铁汉指挥的部队在如皋地区遭遇了新四军的主力，并被困在敌人的包围圈中。在新四军的猛攻下，王铁汉的部队损失惨重，整编49师几乎全军覆没。

尽管如此，王铁汉并未受到过多责难，因为他早已获得了陈诚的支持，并在随后的战斗中重新整编部队。然而，经过这一连串的失败，王铁汉对继续军旅生涯产生了厌倦，尤其是在105师的覆灭之后，他更加痛惜失去了这支在抗战中曾屡立战功的队伍。

1948年，王铁汉请辞军长职务，改任辽宁省主席。然而，随着辽沈战役的爆发，王铁汉不得不再次陷入战乱。在沈阳的撤退过程中，东北的蒋军彻底失败，第49军这个番号也随之消失。东北的抗战遗存，终究在内战的硝烟中消逝。