故宫里现存雍正朝数万件原始秘档，其中最多的是详加批点的密折。雍正借助密折制度把自己的触角伸向各地，无处不及。

所谓秘密奏折，就是折子报皇帝亲拆御览，皇帝用朱笔批于折后，然后再密封发还给原奏人，所有内容只有君臣二人知晓。臣子得到朱批，会根据朱批上的指示行事，清朝的很多皇帝都善于利用朱批激励朝臣。对于臣子来说，这是一种激励也是一种荣誉。

雍正刚登基便下了一道有关密折的谕旨。在他钦定的规章里，从缮折、装匣、传递、批阅、发回本人再缴进宫中，都有一定的程序。按照密折的内容，分别规定用素纸、黄纸、黄面纸、白面纸四种纸写，并使用统一规格的封套密折须本人亲笔，臣工写完后，加以封套、固封，装入特制的折匣，用宫廷锁匠特制的铜锁锁住，并派专人送达。

对于官员来说，上书密折是一个与皇上交流的机会。雍正之前，只有中央派到地方上的常设官员，如江宁、苏州织造等有权密奏。康熙一朝密奏者只有百余人，而雍正朝却达1100多名，逐步扩大到各省督抚、藩等。然而，雍正朝的密折不但用来陈事，还用来荐人他给官员授权，允许越境奏事、可以越级监视，上下牵制。

雍正的朱批，嬉笑怒骂，极有个性，他驾驭臣子尤其擅长恩威并施。并且通过这些常人喜怒哀乐的一面，我们可以更全面地了解雍正。他的朱批很多是带着情结色彩的，如表示喜悦之情的折子：“好事，好事，此等事览而不嘉悦者除非呆皇帝也！”

大臣们面对雍正的朱批更是很谨慎地对待，对于皇帝的责备更加严于律己，对于皇帝的安慰和关怀更是感激涕零。他们对皇帝更加忠心耿耿，鞭策自己更加上进

臣子向皇帝上奏密折的行为，一直延续到清朝末年。鸦片战争期间，英法联军在广州缴获了一些两广总督英写给道光皇帝的密折，其中一些侮辱洋人的语言让英国人怀恨在心、后来英在谈判时遭到英国人的当面羞辱，中途离去，结果以失职罪被皇帝赐死。