朱棣在“靖难之役”取得胜利后，如何处理朱允炆及其兄妹和子女的问题，成为历史上一个引人关注的故事。 1402年，当朱棣攻陷南京城，称帝之际，他对自己的侄子吴王朱允熥的封号进行了降级，改封为郡王广泽王，并将其迁往漳州居住。在历经三个月的时间后，朱棣再次召回朱允熥，最终降其为庶人，并将其囚禁在凤阳，过上了无自由的生活。

朱允熞是朱允炆的亲弟弟，系朱标的第四个儿子，封号衡王，由于战事未能开始他的藩地治理。因此，朱允熞与其兄弟朱允熥和弟弟朱允熙一起，被朱棣降封为郡王怀恩王，居住在建昌。同年，他与朱允熥共同被召回京城，最终陷入庶人的身份，并同样被禁锢在凤阳，直至他去世的那一刻。

徐王朱允熙则因年幼，仅有十二岁，未曾出藩，侥幸逃过了朱棣的清算。他以敷惠王的身份，和母亲吕氏一同在朱标的陵墓附近生活，竭尽全力地侍奉已故的父亲朱标。然而，命运似乎并未对他宽容，最终他在一场突如其来的府邸大火中不幸夭折，年仅十六岁。朱棣在朱允熙去世后，罕见地授予了他“哀简”的谥号，使他成为了唯一一位在永乐朝时期被赐予谥号的朱标之子。

朱标除了生有上述三子外，还有长女江都公主、次女宜伦公主以及三、四女南平郡主。长女江都公主，最初被封为江都郡主，于1395年下嫁给长兴侯的庶子耿璿。然而，当朱棣称帝后，耿璿誓言绝不屈服，最终被朱棣杀死，江都公主因此被降为郡主，随即陷入忧愁而去世。次女宜伦公主最初被封为宜伦郡主，朱棣夺位后，她的封号亦被改为郡主，但她得以安然度过，最终在永乐十五年嫁给了一位普通百姓。三女的生平则无从考证，而四女南平郡主于1412年去世，去世后朱棣追封她为南平郡主，以示尊重和纪念。

朱允炆有两个儿子，分别名为朱文奎与朱文圭。朱文奎自出生便被立为太子，但在朱棣攻入南京城时，他仅六岁，便与父亲建文帝一同失踪。朱文圭则年仅两岁，被朱棣囚禁于皇宫之中。待到明英宗时期，朱文圭才重获自由，但不久后便撒手西去，享年58岁。这个家族的悲剧，成为了历史上一段令人痛心的插曲。