1925年3月12日，59岁的孙中山先生在北京病逝，孙中山先生生前希望把自己的遗体保留下来，以供人们瞻仰，入殓之前，由北京协和医院对遗体做了防腐处理，力求保存完好。

苏联方面在得知孙中山先生病逝后，也随即送来了一口水晶棺，用来安放遗体，不过由于路程原因，水晶棺送来时遗体已经入殓，只能暂时存放以待再用。

按照孙中山生前叮嘱，死后要葬在南京的紫金山，病逝在北京属于突发事件，南京的墓地还没有建好，只能是先放在北京，于是孙中山的遗体存放在北京的碧云寺。

由孙中山生前的侍卫守护，这些人都是忠心耿耿的侍卫，另一头，南京方面的丧事筹备会正在征集陵墓的设计方案，通过海选的方式进行，最终“自由钟”的设计方案被采用。

有了设计方案，紧接着就是动工修建，原本计划是用14个月的时间修建完成，可是由于战争等原因，工程的进展受到了影响，一直到1929年3月，主体工程才算完工。

而在碧云寺里面，保护孙中山先生遗体期间还出现了一件大事，那是在1926年，也就是陵墓修建的第二年，革命军把大军阀张宗昌打的打败，张宗昌逃往北平躲避。

战败的张宗昌很是窝火，这股是要泄掉才行，于是张宗昌想起了碧云寺里孙中山的遗体，张宗昌扬言要派兵去烧了孙中山的遗体，守护的卫士都担心不已，毕竟看守的人少。

于是卫士们匆忙对孙中山遗体进行转移，藏到了碧云寺附近的一个山洞里，就这样才躲过一劫，后来证实，张宗昌确实去了碧云寺，没有找到遗体才作罢的，实在太险了。

遗憾的是，避开了军阀张宗昌的破坏，却没有避开腐坏，由于转移过程中导致防腐效果变差，遗体有的已经出现了黑色，再加上陵墓的主体过程一直到1929年才算完成。

这样一来遗体存放的时间太长了，1929年4月23日，何应钦被派往北京，担任迎接灵柩的总指挥，5月26日，灵柩从北平南下到南京，用了3天时间，于28日抵达南京。

随后停灵3天，以供各界人士进行祭奠活动，按理说在换棺椁的时候可以换入水晶棺之中，不过由于防腐效果不理想，已经难以供人瞻仰了，只好采用封墓的方式进行安葬。

6月1日这天，孙中山先的灵柩被送入墓室，墓室外用钢筋水泥密封的十分严实，寻常手段是打不开的，如今中山陵已经成为了一大旅游胜地，去南京玩的人，都会去看看中山陵。