据《纵横》2010年第八期《人物春秋·红色间谍——郭汝瑰将军二三事》一文记载，杜聿明在获得特赦后再度见到了郭汝瑰。杜聿明感慨道：郭汝瑰呀郭汝瑰，当年我们吃败仗都吃在你手里。郭汝瑰则淡淡一笑回答：各为其主嘛。杜聿明疑惑地问道：你那时就和共产党有联系？郭汝瑰点了点头，回答：是的，你从哪里得到的消息？杜聿明回应：从山东方面。郭汝瑰又问：这人是谁？杜聿明故作神秘：这是秘密，不能告诉你。郭汝瑰微笑着说：那么，为什么你不告诉我呢？杜聿明苦笑着说：我曾经告诉过，只是没起作用。

杜聿明对郭汝瑰的怀疑并非没有原因：当蒋军依照郭汝瑰提出的作战计划进行作战时，几乎每一场战斗都以失败告终。张灵甫、黄百韬等将领被击毙，杜聿明、黄维则被俘，这一切都与郭汝瑰有关。查阅史料，我们发现一段有趣的记录：1948年7月7日，蒋中正派顾祝同力邀郭汝瑰再度担任国防部第三厅厅长，并参与设计辽沈、淮海、平津三大战役的作战方案。何应钦、陈诚、顾祝同、白崇禧等人都对郭汝瑰的作战方案表示赞赏，连蒋中正也十分欣赏。然而，郭汝瑰的作战方案并非毫无缺陷，它的独特之处在于，每次他都提交两份作战方案，一份交给蒋中正，另一份交给解放军的指挥部西柏坡。每当蒋中正批准郭汝瑰的作战方案时，他的计划便顺利实施。1948年11月22日，黄伯韬兵团在碾庄圩被全歼，黄百韬自尽；12月14日，黄维兵团在双堆集被全歼，黄维被俘；1948年1月10日，杜聿明亲自指挥的邱清泉和李弥兵团先后被歼灭，邱清泉被击毙、杜聿明被俘，李弥和胡琏则侥幸逃脱。

郭汝瑰第二次出任国防部第三厅厅长时，负责了三大战役的作战计划。事实上，郭汝瑰第一次担任这一职务是在1947年3月5日，时任陈诚推荐他担任这一职务。随后不久，郭汝瑰便通过联络员任廉儒将与陈诚、刘斐、侯腾在蒋中正官邸开会的内容传递出去，这些情报最终导致了张灵甫和整编七十四师在孟良崮的全歼。郭汝瑰在潜伏期间泄露了大量重要情报，至今很难统计清楚。值得注意的是，那些最早怀疑郭汝瑰的人——尤其是那个比杜聿明更早怀疑他的山东人士——究竟是谁，仍然是一个值得推敲的问题。杜聿明回忆道，淮海战役开始之前，他就意识到自己可能陷入了蒋中正与郭汝瑰的圈套。在回忆文章《淮海战役始末》中，他提到自己从未想过成为徐州剿总前线指挥部主任，并表示自己是带着赴刑场的心情上战场的：我心中忐忑不安，觉得上了蒋的当，认为蒋、顾祝同听信郭汝瑰这个‘小鬼’的摆布，才导致了这一糟糕的局面。他当时犹豫着想质问郭汝瑰，为什么不按原定计划将主力撤到蚌埠附近，但由于顾祝同等人都同意郭汝瑰的报告，杜聿明认为与其争辩，不如顺从。

蒋中正、陈诚、顾祝同、白崇禧等人看重郭汝瑰，一方面因为郭汝瑰清廉无私，另一方面则是因为他的作战计划确实精妙。如果没有外泄的备份，这些计划简直是完美无瑕。郭汝瑰巧妙的设计并未被蒋中正或顾祝同等人察觉，甚至连杜聿明也未能看出其中的隐患。蒋中正以清廉自居，自然不会怀疑郭汝瑰，杜聿明的举报也显得徒劳无功。而最早提醒杜聿明郭汝瑰是卧底的人，显然并不受到蒋中正的重视，甚至连告发的机会都没有。熟悉历史的读者应当知道，王耀武的地位并不低于杜聿明，如果他怀疑郭汝瑰，完全有权直接向蒋中正报告。然而，王耀武对此并未表示怀疑，反而当时并不信任杜聿明的猜测。顾祝同刚刚接任参谋总长，并力荐郭汝瑰再次担任第三厅厅长时，杜聿明曾因郭汝瑰与解放军的联系提出反对意见，但顾祝同却训斥了他：你不要疑神疑鬼！郭汝瑰跟我一起待了超过一年，他非常忠诚，办事能力也很强。

1948年11月4日，蒋中正派参谋总长顾祝同和作战厅长郭汝瑰到徐州传达作战命令，决定守住徐州。命令中明确要求邱清泉兵团向徐州集结，李弥兵团向泗县和灵璧集结，孙元良兵团在涡阳和蒙城集结，并且让其他部队按计划调集。然而，这一系列的集结命令实际上是将蒋军各部队集中在一个地方，方便陈粟和刘邓大军围歼。11月6日下午6时，李以劻和第九绥靖区司令李延年抵达新安镇第七兵团司令部，黄百韬见到他们时几乎要哭出来：作战厅的郭汝瑰、许朗轩、张宗良等人作出这样的计划，实在让人伤心。大军的作战计划一再变动，军心不稳，士气低落，难道他们不知道吗？

黄百韬在半夜再次请李以劻密谈，这次他说得更为伤心：国防部的作战计划一再修改，部队总是被动应对，正是因为将帅无能，才让三军陷入困境。这次会战如果失败，我们将一无所有。我们根本打不过解放军，敌人对于上级指示都毫不动摇，而我们则是阳奉阴违。从杜聿明的怀疑、举报，到黄百韬的伤心之语，我们可以看到，蒋中正手下的将领并非都是无能之辈，但越往上，局势就越糟糕。徐州的实际指挥权在刘峙而非杜聿明手中，刘峙根本不敢违背蒋中正的命令，也不敢反对郭汝瑰的作战计划。即便他看出问题，也无法提出异议，甚至可能认为这是一个完美的计划。

此外，文强回忆称，杜聿明两次派参谋长舒适存飞南京见蒋中正，都是通过郭汝瑰安排的，而舒适存当时也陷入了两难境地：一方面是蒋中正召见，另一方面又是杜聿明要求他瞒着郭汝瑰。等到蒋中正终于见到杜聿明的突围计划时，一切已经为时过晚。按照杜聿明幻想中的‘第三策’突围计划，实际上已经全盘落空。