首先，来厘清一下东南互保的基本概念。公元1900年，慈禧太后一时冲动，颁布诏书向当时的十一国列强正式宣战。随即，组成八国联军的不到两万士兵开始在大沽口登陆，导致八国联军侵华战争全面爆发，国家危机深重。

为寻求自保，东南各省的督抚们紧急联手，秘密与外国势力进行勾结，达成了一个协议。这个协议的核心内容是，外国势力将继续管理上海租界及其势力范围，而各省督抚则承诺在各自的管辖区域内维持稳定，不会派兵干预朝廷与洋人之间的纷争。事实上，这表明他们不会派兵北上支援清朝。最终，八国联军成功攻占了北京，慈禧太后被迫带着光绪帝西逃。无奈之下，她只能与西方列强签署《辛丑条约》，接受了割地赔款的严苛条件。

那么，为什么慈禧太后没有对这些不听指挥的东南督抚施加惩罚呢？首先，这些督抚手中掌握着巨大的权力，与洋人早已建立起密切的联系。清朝当时已被外敌打压得不堪一击，《辛丑条约》刚刚签订不久，东南互保政策实际上符合列强的利益。如果慈禧太后贸然对这些督抚进行处罚，势必会引发外交上的纷争，届时如果列强介入，那无疑会让局势更为复杂。

由于在镇压太平天国运动中表现突出，南方各省的地主武装纷纷获得了总督和巡抚的职位，他们不仅手握兵权，还掌控了地方的财政与民政事务，使得朝廷的中央集权大大削弱，形成了“内轻外重”的尴尬局面。慈禧太后作为清朝的首脑，为了维护统治的延续，必须依赖这些汉族官僚，这也是她的一种无奈之举。

另一方面，慈禧太后必须找到一个合理的借口或者罪名，才能够有理有据地对这些地方大员进行处理。然而，这些督抚都在官场中游刃有余，颇有生存之道，使得慈禧很难寻找到合适的理由来加以惩处。

这些东南督抚中包括了李鸿章、刘坤一、张之洞、许应骙和袁世凯。李鸿章是淮军的领军人物，对洋务和外交事务颇有造诣，在当时风雨飘摇的清朝廷中备受依赖，毫无可能受到处罚。刘坤一是湘军的代表人物，同样掌握着实权，更是汉族官僚的典型。若慈禧动他，势必引发官场的震荡。张之洞作为洋务派的支持者，慈禧太后在以后的统治中还需要他的扶持。而袁世凯则凭借奉承得到了慈禧的宠信，不仅未遭受惩罚，反而得到重用。只有许应骙被免去官职，实属例外。

在清朝末年，革命党四处兴起，动乱不断。为了维稳摇摇欲坠的清政府，慈禧不可避免地要依靠地方督抚的联合镇压，以保障自己的统治地位。面对如此危机四伏的局面，她根本无暇对这些督抚进行处罚。