在三藩之乱的初期，朝廷对于突如其来的叛乱措手不及，西南的各省迅速沦陷。这一场战事之所以能够在短时间内迅速取得巨大胜利，吴三桂的军队兵力充足、粮草充盈，是不可忽视的重要因素。那么，吴三桂反叛清廷时，究竟拥有多少兵马呢？

在讨论吴三桂的兵力时，我们首先要明白清代各省的驻军都有统一的兵额，无论是八旗军还是绿营兵，都有固定的标准。早在崇祯十七年，吴三桂驻防山海关时，他的军队就已经有三万精锐的辽东兵力，这些兵员构成了吴三桂的“初始家底”。然而，在山海关大战后，虽然在多尔衮的支持下，吴三桂成功取得胜利，但这场战斗也给他带来了惨重的损失。多尔衮命令吴三桂追击李自成，当时吴三桂的兵力仅剩下“分隶步、骑兵一万”，这说明他入关后的兵力大大减少，降至一万左右。

随着时间推移，吴三桂逐步定下陕西、四川、云南等地，他的军力也逐渐得到补充和壮大。吴三桂不仅征服了缅甸的永明王，还平定了水西土司的安氏部族，经历了多次的战争，他的军事实力也在不断积累。他收编了大量的兵员，主要来自大顺、大西农民军旧部，以及南明永历政权的官军。据统计，仅在云南，吴三桂就俘获或招降了永历朝廷的官兵和家口多达八万余人，其中包括不少大西农民军的余部。许多勇将如马宝、王会、塔新策、高启隆、狄三品等，也加入了他的麾下。原本就战斗力极强的平西甲兵，在吴三桂的调度下，迅速组织成“忠勇”、“义勇”十营，极大地增强了军力。

在关于吴三桂兵员的统计上，魏源的《圣武记》一直被认为是最权威的记载。魏源书中提到：“三桂藩属五十三佐领，绿旗兵万有二千，丁口计万……设前后左右援剿四镇，分十营，每营兵千有二百。”虽然不同史料中对吴三桂的兵力有所不同的描述，但一般都采用魏源的说法，把吴三桂的兵员定为“五十三佐领，绿旗兵一万二千”这一标准。吴三桂的藩属兵力基本可以根据这个数字来估算。

对于吴三桂的藩属兵员，值得注意的是，三藩下的军队由满洲汉军旗和绿营两部分组成，旗兵人数是固定的，五十三佐领的旗兵总数为10600人，这一点没有异议。然而，绿营兵的数量就比较难以精确统计了。吴三桂建立绿营的确切时间无法考证，但从他定陕、定川、定滇等战役中，不断吸纳大量兵员，这些新增兵力都加入了绿营。到顺治十七年六月，吴三桂的绿营兵力已达到6万人。

如此庞大的军队，无疑给朝廷带来了巨大的财政压力。为了解决这个问题，清廷在处理云南的裁军和筹集军饷时，召开了议政王大臣会议。最终决定停止云南绿营兵的招募，要求投诚官兵回乡务农，并将吴三桂的绿营兵数额限制在三万人。尽管吴三桂曾通过各种借口拖延裁军，但由于朝廷的强制命令，他也不得不妥协，执行这一兵员限制。自此，吴三桂的藩属绿营兵有了一个相对固定的编制，即十营和四镇。

根据《清实录》记载，顺治十七年7月，清廷决定将云南的投诚兵员改编为藩属绿营，总计12000人，分成十营，每营约1200人。此外，十月，吴三桂再度奏请设立四镇，以马宁、沈应时、王辅臣和杨斌为总兵，四镇每镇驻守3000兵力，兵额总计24000人。这样一来，吴三桂的藩属兵力总计达到34600人，包括旗兵、绿营以及四镇的兵员。

值得注意的是，以上统计仅为朝廷规定的常规兵力，实际上吴三桂私下招募的兵力以及临时调动的兵员并未计入其中。根据顺治十七年的数据，朝廷为云南省拨出的军饷为九百万两。按照当时的军饷标准，马兵月给二两银，步兵为一两五钱，而守兵则为一两。换算下来，九百万两的军饷足以支持约37.5万兵力。如果吴三桂精简老弱，广收精锐，组建起一支强有力的队伍，他的兵力数量很可能远超这一定额。综合考虑三藩之乱时期的激烈战斗，吴三桂的兵力估计不低于15万。