袁崇焕原来任辽东巡抚时,曾与后金进行过和议谈判。这次他复镇蓟辽,在崇祯帝面前许下五年复辽的诺言。他自“知兵力不敌,思以捭阖纵横之计”达到目的,即想用和议使后金让出辽东地区。因此,袁崇焕便不顾崇祯帝和一些廷臣的反对,积极与后金进行谈判。
皇太极表面上和袁崇焕书信往还进行议和,暗中却积极备战。他感到宁、锦正面防线不易突破,便决定绕道蒙古,进攻明朝。崇祯二年(天聪三年,1629年)十月,皇太极亲率十万大军从蒙古绕道进关。当时明朝仅袁崇焕在宁、锦一带布有重兵,山海关以西则塞垣颓圮,军伍废弛。
所以后金兵没有遇到什么阻挡,直抵遵化,巡抚王元雅自杀,三屯营副总兵连夜逃遁,“总兵朱国彦忿甚,揭逃将名氏于市,散家财给众”,同妻子上吊自杀。著名将领山海关总兵赵率教率兵入援,战死于遵化城下。后金攻下遵化后,直趋京师。这时,袁崇焕也急忙率兵入援,于十一月十日抵蓟州。但后金兵却越过蓟州西进,连下三河、香河诸城。袁崇焕急率兵去保卫京师,驻兵于广渠门外,因士马疲敝,请求到城中休息,被朱由检拒绝。这次后金兵突破的关隘,是刘策所管的地域,袁崇焕“甫闻变,即千里赴救自谓有功无罪”。
但当时京师的人们骤遭兵祸,怨恨“崇焕纵敌拥兵”,和他有仇隙的官僚因前通和议,诬其引敌胁和将为城下之盟”。正在这时,皇太极又设下反间计。后金在京畿牧马厂抓获了两个明朝太监,监禁在军营中。皇太极叫他的部将在夜间对话中,窃窃私语说:袁崇焕与后金有密约,我们可以不动一刀一枪进入北京。两太监中的杨姓太监闭着眼睛装睡,把他们的对话记在心里。第二天,后金有意纵放了杨太监。他进入北京城后,就立即向朱由检报告了袁崇焕通敌的机密情报。
朱由检本来就好猜疑,听了杨太监的报告,遂相信了京师对袁崇焕的种种传说。十二月一日,朱由检召袁崇焕、满桂、祖大寿于平台,责问袁崇焕:“以前杀毛文龙,今逗遛,何也!”一时间,崇焕不知如何回答,遂被逮捕下狱。在一旁的祖大寿吓得浑身发抖,待出城后,他就率领军队逃回山海关,后逃向宁远。朱由检于狱中取崇焕手书,派人去召回祖大寿。袁崇焕被逮捕后,魏忠贤余党王永光、高捷、袁弘勋等谋兴大狱,力攻袁崇焕“擅主和议,专戮大帅”两事。最后,法司判以谋叛罪,于崇祯三年(1630年)八月处以最残酷的磔刑,并没收他的家产,兄弟妻子流三千里。
袁崇焕被冤杀,但当时人们都认为他是通敌叛国,一直到清入关后修清太宗皇太极实录时,真相才大白于天下。
袁崇焕被捕下狱后,朱由检以满桂为武经略尽统入卫诸军,并催促他出战。满桂骁勇敢战,但当时“敌劲援寡”,他认为“未可轻战”。而朱由检却不顾实际情况,不断派人催促,满桂不得已“挥涕而出,以五千人同孙祖寿等战安定门外”,以寡不敌众,壮烈牺牲。另两员将领黑云龙、麻登云被俘,投降后金。后金诸将纷纷要求攻城,皇太极却说:“城中痴儿,取之若反掌耳!但其疆域尚强,非旦夕可溃者,得之易,守之难,不若简兵练旅,以待天命可也。”崇祯二年(1629年)十二月末,皇太极率军东归,沿途攻下遵化、永平、滦州、迁安四城,派兵驻守,其余部队都返回沈阳。