永乐八年，也就是公元1410年，明成祖朱棣亲自率领约50万大军，开始了他首次北伐蒙古的重大战役。这次北伐的目标直指北元蒙古的可汗——孛儿只斤·本雅失里。朱棣此行目的明确，志在彻底削弱北元的势力，稳固明朝的北疆安全。

面对明军强大的军力，本雅失里深知自己无法与之正面抗衡，于是决定采用撤退战略，以空间换取时间，意图拖延明军，让其因粮草短缺而被迫撤退。这是一种颇为老练的战略，典型的以退为进，企图通过耗尽对方后勤资源来逆转战局。

然而，在具体撤退的路线选择上，本雅失里和他的太师阿鲁台之间发生了激烈的争论。本雅失里倾向于向西撤退，希望能借助强大的帖木儿帝国的力量，寻求外援，以图东山再起；而阿鲁台则坚持留守蒙古东部的根据地，主张向东撤退，死守已有的地盘。两人的理念截然不同，谁也没能说服对方。

最终，君臣二人分道扬镳，各自率领一支军队向东西两个方向撤退，这种分裂无疑给了朱棣绝佳的机会。明军凭借数量和装备上的优势，可以逐一击破这两支蒙古军队，极大地削弱了蒙古的整体战斗力。

同年五月，朱棣亲自挑选精锐部队，发动长途追击，终于在斡难河畔将本雅失里主力部队击溃。本雅失里仓皇逃窜，仅带着七名骑兵逃往瓦剌地区。然而，不幸的是，他最终被自己的妹夫、瓦剌的首领马哈木所杀，时年仅二十七岁。紧接着，阿鲁台的部队也未能幸免，于六月在兴安岭东部的答兰那土儿哥一带被朱棣重创，被迫遣使向明朝进贡，求和以保全实力。

本雅失里死后，蒙古皇室嫡系似乎已被消灭殆尽。为在政治上与西部瓦剌部抗衡，阿鲁台拥立了成吉思汗弟弟孛儿只斤·拙赤合撒儿的后裔——孛儿只斤·阿岱为东蒙古可汗。而瓦剌首领马哈木则支持元世祖忽必烈弟弟孛儿只斤·阿里不哥的后裔孛儿只斤·答里巴为西蒙古可汗。

这便造就了蒙古史上罕见的“双大汗”局面，东蒙古和西蒙古两个可汗并立，长时间内相互争斗，严重削弱了蒙古大汗的权威。两方的持续冲突也让蒙古的政治格局陷入动荡不安。

公元1416年，阿鲁台趁西蒙古被明军打击重创之机，主动出击，一举斩杀了马哈木和答里巴，还俘获了马哈木的儿子脱欢。脱欢最初在阿鲁台府中充当家奴，受尽屈辱，后来因种种原因被释放，返回西蒙古。

随后几年，阿鲁台带领东蒙古军队不断向西蒙古发起猛烈进攻，同时还派兵南下骚扰明朝边境。朱棣见阿鲁台势力日益壮大，忧心忡忡，不得不亲自出征，分别在永乐二十年、二十一年、二十二年发动三次北伐蒙古战役。前三次战役中，除最后一次无果而终外，前两次均对阿鲁台形成了有效打击，使东蒙古势力逐渐衰弱，被西蒙古赶超。

随着西蒙古，也就是瓦剌势力的崛起，局势反转。到公元1430年，瓦剌在与东蒙古的战争中取得决定性胜利，阿鲁台及其支持的孛儿只斤·阿岱在克鲁伦河和呼伦贝尔地区的根据地被瓦剌夺取。四年后，瓦剌首领脱欢发动猛烈进攻，成功刺杀阿鲁台，孛儿只斤·阿岱则带着残余部队逃往内蒙古西部的阿拉善地区。

阿岱在阿拉善继续领导东蒙古军队与瓦剌展开顽强抵抗，苦苦支撑了四年。但终究力不从心，到了公元1438年，面对瓦剌与明朝的夹击，东蒙古被彻底击溃。阿岱本人惨遭杀害，东蒙古大部分部众被瓦剌征服。瓦剌在其所拥立的元朝裔大汗脱脱不花旗帜下，实现了短暂的统一。

这段历史不仅反映了蒙古各部之间的权力争夺，也展示了明朝对蒙古事务的深刻影响，揭示了蒙古大汗权威衰微及地方割据势力崛起的复杂局面。