在太平天国最鼎盛的时期，太平军拿着下了大清的江南重城南京，这是一座明代古都，地理位置十分的重要，所以，在这里的清军把守军队的战斗力也非常的强悍，杨秀清更是亲自指挥军队进入攻城，因为他知道，南京城一定会是一块难啃的骨头，因为在那里的南京城里，有一处名为满城的地方，那里全部是由旗人把守的，而非汉军，约有两万的旗人军队，那里也是明朝皇宫的旧处。

在攻入南京城之时，太平军无论是在人数还是在火力上，都是有着相当的优势的，尤其是新加入太平军的大炮，更是使太平军在声势上更加的强盛，因此对于南京城外围的战争，虽然也很激烈，但是太平军基本上都是没有什么悬念的拿了下来。汉人军队在对战太平军之时，战斗力并不怎么样，反而是只有两万人的旗人军队，他们几次对太平军造成了不小的打击和损失，这主要是因为这些旗人都知道，如果自己一旦落入了太平天国的手里，是万不可能有生还的可能的，完全就是一支没有后路的决死之师了。

在太平军攻击满城的时候，旗人们全部都斗志高昂，老人孩子皆出来叫阵助威，旗人就连女子都拿起武器到城墙上与太平军进行战斗，战斗的激烈程度一度进入了白热化。杨秀清连续发动三次强攻，都被勇猛无比的旗人所打败，几仗下来，太平军阵亡数千人，尸体堆积如山。

但是对于南京，太平天国已是志在必得，无论旗人做什么样的反扑，杨秀清无论付出多大的伤亡，都一定要拿着南京城内最难啃的这块骨头，最终杨秀清在分析了战场之后，决胜用车轮战的方式对付剩下的这些旗人，因为他们的人数是非常有限的，而在这方面太平军的优势实在是太大了。

就这样，太平军轮番上阵与旗人进行搏杀，旗人越战越少，最终力不能敌了，太平军将所有的旗人一律斩杀，清军主帅祥厚眼看大势已去，随即自刎而亡，就这样，太平天国在付出数万人的惨痛代价后，终于全面占领南京。

在这场战争之中，旗人的表现非常的亮眼，他们几乎战至最后一丝力气，个人认为这主要是因为太平天国与清朝之间存在着意识形势上的本质不同，太平天国所打出的旗就是“消灭清妖”，对于旗人又怎么可能会有任何仁慈的一面呢？也正是因为太平天国的这个特点，所以旗人们才在明知会城破的前提之下，仍然拼尽全力地与之战斗，不可谓不悲壮。

而占领了南京城之后的太平天国，也达到了其势力的最顶峰，接下来就是天王和各王开始入驻，将南京改名为天京，作为太平天国的都城，而清朝在失去了南京之后，开始调集更多的力量与太平天国作战，清朝在扬州建立了江北大营，在南京城东孝陵卫一带建立江南大营，这两座大营一直一左一右的严重威胁着太平天国都城的安危。