朱祁镇是明朝历史上非常特殊的一位皇帝，他曾两次登基。当初，朱祁镇的第一次失去皇位是因为他听信太监王振的谗言，亲自带领50万精锐军队出征瓦剌，结果在土木堡遭遇惨败，不仅损失了大量的军队，还被瓦剌俘虏，甚至差点被用作人质威胁北京城的开门。这个灾难性的事件几乎导致了明朝的灭亡。危急时刻，于谦挺身而出，立了朱祁镇的弟弟朱祁钰为新皇帝，并成功守住了北京城。瓦剌在失败后撤退，朱祁镇一年后被释放，回到了北京。

然而，朱祁镇回到京城后，面临的却是一个非常尴尬的局面——“一山不容二虎”。作为新皇帝的朱祁钰，显然不可能轻易放弃自己辛苦得到的权力。为了避免直接冲突，朱祁钰尊称朱祁镇为太上皇，并把他软禁在南宫。这样，朱祁镇表面上恢复了权力，实际上却被限制自由。

朱祁镇在南宫软禁了8年之久，直到最终发动了著名的“夺门之变”，重新掌握了大权。此时，朱祁钰的健康状况已经很差，且命不久矣。如果朱祁钰早知道有一天会如此，他在朱祁镇回朝初期或许就会果断将其除掉。其实，朱祁钰没有在那时直接杀掉朱祁镇，主要有几个原因：

首先，孙太后是朱祁镇的亲生母亲，在这个时期她的意见非常重要，而她不可能同意杀害自己的儿子。其次，像于谦这样的重臣也不支持朱祁钰这么做，他们当时的心态是希望通过维护兄弟情谊与家庭稳定来保全局势。另外，朱祁钰也考虑到了自己的名声，他作为一个新皇帝并不希望被历史评价为杀害亲弟的暴君。最后，可能还有一些私人情感的原因，朱祁钰毕竟与朱祁镇是亲兄弟，也许他心中还是有些顾虑，不忍心做出如此决绝的举动。

总的来说，朱祁钰未能在早期将朱祁镇除掉，是因为当时他不仅缺乏完全掌控朝局的能力，还有外部的压力和内心的纠结。而当局势到了“夺门之变”时，他已无力回天。