在取得牛渚大捷后，孙策迅速转身发动进攻，目标是秣陵的笮融。激烈的战斗中，孙策的不幸遭遇了一支流箭，箭矢击中其大腿，令他无法再骑马作战。于是，他不得不暂时撤回牛渚营地进行治疗（策复下攻融，为流矢所中，伤股，不能乘马，因自舆还牛渚营）。

孙策每次亲自上阵，身先士卒的精神极大地激励了士兵。将领带头拼命，底下的军士怎么能轻易退缩呢？正是这种士气，使得孙策的军队几乎无人能敌。

就在孙策受伤的消息传开后，孙策军中有间谍向笮融泄露了一个重磅消息：“孙郎已被箭射中，命已不久。”从后来的事态发展来看，这显然是孙策故意散布的假消息——他不仅勇猛无比，还巧妙地运用了兵法和计谋。

笮融听闻孙策中箭的消息，心中暗喜，认为自己终于迎来了击败敌军的机会。他立刻派遣手下的部将于兹，带领军队向牛渚大营发起进攻（融大喜，即遣将于兹乡策）。

然而，孙策早有准备，巧妙地设下了一个诱敌之计。他先派出数百步兵骑兵迎战，随后在后方埋伏了重兵。经过一场短暂的交战，孙策指挥先锋故意装作败退，引诱敌军追击。笮融此时根本没有疑虑，认为孙策军心已经动摇，便急忙命令部队追击，结果却掉入了孙策的伏兵圈套。敌军被彻底击溃，斩首千余人，尸横遍野（贼出击之，锋刃未接而伪走，贼追入伏中，乃大破之，斩首千余级）。

接着，孙策趁机发起反攻，他命令左右军士大声呼喊，朝笮融的军营问道：“孙郎到底怎么样？”（策因往到融营下，令左右大呼曰：“孙郎竟云何。”）笮融听闻此喊，顿时惊慌失措，最终彻底崩溃，连夜撤离战场（贼于是惊怖夜遁）。

经过这一番大战，孙策顺利攻占了秣陵，并迅速展开北上攻势，接连攻下湖熟、江乘、句容等城池。此时，曲阿也已经处在孙策的铁蹄之下！

然而，就在孙策逐渐稳住江东局势时，刘繇却遇到了困境。正当他束手无策时，太史慈的到来为他带来了希望。太史慈，字子义，东莱人，武艺高强，箭无虚发，为人忠诚，重情重义。

北海相孔融曾对太史慈的母亲有过诸多关照，当时孔融还派人送食物和慰问品（北海相孔融闻而奇之，数遣人讯问其母，并致饷遗）。后来，孔融被黄巾军围困，形势极为危险（时融以黄巾寇暴，出屯都昌，为贼管亥所围）。

太史慈母亲见儿子情深义重，于是告诫他：“你和孔北海素未谋面，但他却如此照顾我们，你应该回报他，前去救援。” 由此，太史慈单枪匹马杀入围城，决心解救孔融。

孔融急于向刘备求援，可是城内没人愿意冒险出城。无奈之下，太史慈主动请求，决定试图带消息出去（融欲告急平原相刘备，城中人无由得出，慈自请求行）。

由于黄巾军的围困非常严密，太史慈决定通过伪装来寻找机会。他每天假装外出练箭，实际上在城下射击，再迅速返回（慈引马至城下堑内，植所持的各一，出射之，射之毕，径入门）。起初围城的黄巾军还保持警惕，但时间一长，他们逐渐放松了警惕（明晨复出如此，无复起者）。

抓住了敌人松懈的时机，太史慈趁机疾驰突围，黄巾军察觉时，他已冲出重围。追兵追来时，太史慈毫不手软，回头弯弓射杀了数名追兵，敌人见状不敢再追，太史慈最终成功突围（於是下鞭马直突围中驰去。比贼觉知，慈行已过，又射杀数人，皆应弦而倒，故无敢追者）。

抵达平原后，太史慈找到了刘备，向他说明了孔融的困境，并请求援助（慈，东莱之鄙人也，与孔北海亲非骨肉，比非乡党，特以名志相好，有分灾共患之义）。刘备听后，立刻派遣三千精兵，随太史慈一同前往解围。

黄巾军得知援兵到了，顿时士气崩溃，纷纷撤退（贼闻兵至，解围散走）。

太史慈解救孔融后不久，得知刘繇正在东海避难，便准备前往拜访。但得知刘繇已赴扬州任职后，太史慈决定南下曲阿，正巧遇上孙策围城。

面对孙策的围攻，刘繇的手下有人建议启用太史慈担任主将，抵御孙策（或劝繇可以慈为大将军）。但刘繇心中有顾虑，他认为太史慈只是个侠士，不适合担任统兵之职。他担心如果任命太史慈为将，许劭会笑话自己（繇曰：“我若用子义，许子将不当笑我邪？”）。许劭，那个以“月旦评”闻名的名士，此时正是刘繇的重要顾问。

最终，刘繇只让太史慈担任侦察任务，去探查敌情（但使慈侦视轻重）。正巧，孙策也派人执行侦察任务，战前亲自探察敌阵和地形，做好充分准备。许多名将，包括后来的唐太宗李世民，都特别重视这种亲自探察战场的方式。

两位“斥候”在吴郡与丹阳郡交界的神亭相遇。太史慈身边只有一名骑兵，而孙策则带着包括黄盖、韩当在内的十三骑。尽管孙策的队伍人数更多，但他并没有借此欺负太史慈，反而以正大光明的方式与其一决高下。

于是，孙策与太史慈展开了一场惊心动魄的单挑。两人拼得难分难解，太史慈一度抢下了孙策的头盔，而孙策也把太史慈的手戟从其颈后拔出。直至双方的主力部队到达，才终于停战（会两家兵骑并各来赴，於是解散）。

这场神亭之战让太史慈的威名传遍四方，但在曲阿城内，刘繇已经失去了抵抗孙策的决心。最终，他接受了许劭的建议，决定逃往豫章郡，打算投靠刘表。

刘繇逃离曲阿后，孙策顺利进入城中，发布公告安民。对于刘繇和笮融的部队，孙策并没有追究，而是容许愿意继续效忠者留在军中。同时，他加强军纪，严禁扰民，江东百姓也对孙策充满了信任，愿意为他赴汤蹈火（而军令整肃，百姓怀之。策为人，美姿颜，好笑语，性阔达听受，善於用人，是以士民见者，莫不尽心，乐为致死）。

孙策的名声，在江东传遍，威震一方！

然而，孙策与袁术之间的裂痕也逐渐加深。袁术得知孙策击败刘繇后，开始担心孙策变得越来越强大，于是